1963 yılında Türkiye akademiler arası futbol şampiyonası düzenlenir. Eskişehir Ticari İlimler Akademisi finalde ege Üniversitesi'ni 6-0 gibi büyük bir farkla mağlup eder. Maçın bitiminin ardından gözlemci Burhanettin Türker, kafile başkanı Nafiz Yazıcıoğlu'nun kulağına şunları söyler " Madem elinizde böyle bir kadro var neden 2.lige katılmıyorsunuz". Bu sözlerden cesaret alan Nafiz Yazıcıoğlu ve arkadaşları kolları sıvar; ancak kurallar gereği mahalli takımların birleşmesi gerekmektedir. Demirspor bu birleşmeye dahil olmak istemez. Neticede İdmanYurdu, Akademi Gençlik ve Esnafspor birleşerek 1965 yılında kulübü kurarlar. Takımın renkleri siyah ve kırmızı olarak belirlenir. Es-Es aldığı başarılar nedeniyle daha sonraki on yıl boyunca Anadolu'da kurulan tüm takımlar Eskiş





Eskişehirspor Türkiye 1. Liginde (Süper Ligde) hiç şampiyon olamamış fakat 3 defa 2.lik, 4 defa da 3.lük alarak diğer Anadolu takımları için kırılması güç bir rekora imzasını atmıştır. 1 Türkiye Kupası, 1 Cumhurbaşkanlığı Kupası ve 3 Başbakanlık Kupası bulunmaktadır. Avrupa kupalarında en iyi başarısı ise 1974-75 sezonunda elde ettiği Balkan Kupası 2.liği olmuştur. UEFA Kupası'nda İspanya'nın dev takımı Sevilla'yı Fethi Heper'in son dakikada attığı üç golle deviren kırmızı şimşekler, Türk futbol tarihinde bir İspanyol takımını eleyen ilk Türk takımı olmuştur. Fethi Heper’in Mikelli (Finlandiya) maçında attığı 4 gol, bir uluslararası karşılaşmada bir Türk futbolcunun attığı en çok sayıda goldür